實驗動物的飼料在收獲、加工、貯存及運輸過程中都有污染病菌的可能，為確保實驗動物質(zhì)量和動物實驗的準確性，我們要通過適當?shù)南痉椒ㄊ蛊溥_到滅菌的目的。用于飼料消毒的常用方法有干熱、濕熱、輻照及藥物熏蒸等多種，目前常用的滅菌方法有以下兩種。
(一)高溫高壓滅菌法
高溫高壓滅菌法是指將飼料在121℃，1.0kg/立方厘米的脈動真空高壓滅菌柜20min以上，將細菌全部殺死。但絕大多數(shù)維生素，尤其是維生素C、維生素B1、維生素B6和維生素A等，遇熱會受到破壞，而純化學性飼料比天然飼料更不穩(wěn)定。
(二)放射線照射滅菌法
γ射線輻照滅菌對多數(shù)維生素和蛋白質(zhì)、氨基酸等營養(yǎng)成分的破壞都比較小。目前，對SPF級實驗動物飼料通常采用吸收劑量25～50kGy左右的60℃照射，對純化學性飼料則應(yīng)適當降低輻照劑量。雖然放射線照射滅菌法在滅菌效果和對營養(yǎng)素的破壞程度方面都優(yōu)于其他方法，但這種滅菌方法會顯著增加飼料成本。